計算環境について

ログイン方法

コンテスト応募者に対して，ログイン方法を個別に連絡します．

コンパイル時の注意点

OpenMPIを利用しますので，下記のようにPATHを設定して下さい．

$ export PATH=/usr/lib64/openmpi/bin:$PATH

ジョブのサブミットファイルについて

ジョブ管理システムにはXBS（旧名称Xqsub）とPBSが利用できます．XBSについては下記のサイトを参考にして下さい．

PBSを利用する場合，下記の文字列を適当なファイル名（ここではtest.sh）でコピーします．下記の赤字の箇所を変更して下さい．

#PBS -l nodes=1
EXE=/home/username/a.out
RUN=/usr/lib64/openmpi/bin/mpirun
NP=2
$RUN -np $NP -hostfile $PBS_NODEFILE $EXE
  • 1行目の"PBS -l nodes="に利用するノード数を指定して下さい
  • 2行目の変数EXEに実行ファイルのパスを指定して下さい
  • 4行目の変数NPに実行するプロセス数を指定して下さい

下記のコマンドでジョブを投入します．

$ qsub test.sh

ジョブ管理コマンドについて

PBSが提供しているジョブ管理コマンドを説明します．

$ qstat -u (ユーザ名)

現在のジョブの情報がわかります．

$ qdel (ジョブID)

指定したジョブを消すことができます．ジョブIDはqstatコマンドから取得できます．

その他のPBSについての情報は下記のサイトが詳しいです．